Тут только вы сами себе сможете помочь...
а может быть здесь трабл /var/run/hostapd-phy0.conf
там driver=nl80211
а в
/etc/config/wireless
mac80211
Я таких тонкостей не знаю. Но насколько понимяю, все что в находится в папке /var/run/ генерируется автоматически, смысла там что-то менять нет.
Основное-это то что у вас wifi без флешки работал, я склоняюсь к мысли что почему-то не перенеслись все файлы на флешку.
Добейтесь работы wifi без флешки, потом перенсите систему, после этого должно заработать без каких либо изменений конфигов wifi.